Các bài viết của ông về các sự kiện lịch sử và hiện tại đã xuất hiện trên tờ New York Times, Wall Street Journal và Washington Post. Trong thời gian làm Uỷ viên cao cấp tại Đại học Lực lượng Đặc nhiệm Joint Special Operations (2013-2015), ông đã xuất bản ba nghiên cứu dài về các hoạt động đặc biệt—tại Colombia, Afghanistan và Mali: Village Stability Operations and Afghan Local Police (Hoạt động ổn định làng xã và Cảnh sát địa phương Afghanistan, 2014),[6] Countering Violent Extremism in Mali (Chống chủ nghĩa cực đoan bạo lực ở Mali, 2015),[7] và Persistent Engagement in Colombia (Cam kết dai dẳng ở Colombia, 2014) [8]

Moyar là tác giả của cuốn sách năm 2006 Triumph Forsaken: The Vietnam War, 1954–1965 (Chiến thắng lãng quên: Chiến tranh Việt Nam 1954–1965). Trong đó, ông cho rằng Ngô Đình Diệm là nhà lãnh đạo gây ấn tượng. Moyar tuyên bố ủng hộ cuộc đảo chính tháng 11 năm 1963 là một trong những sai lầm tồi tệ nhất của Mỹ trong chiến tranh. Những sai lầm lớn nhất khác theo Moyar là: thất bại trong việc cắt đứt đường mòn Hồ Chí Minh, và việc Quốc hội Mỹ từ chối hỗ trợ chính phủ Việt Nam Cộng hòa sau khi Hiệp định Hòa bình Paris năm 1973 bị vi phạm và từ chối viện trợ khẩn cấp cho Việt Nam Cộng hòa vào lúc gần kết thúc chiến tranh.

Triumph Forsaken gây ra một sự khuấy động lớn và nhiều ý kiến đánh giá, một số tiêu cực, cũng như một số tích cực. Đáp lại những phản ứng của cuốn sách, Andrew Wiest và Michael J. Doidge đã chủ biên cuốn Triumph revisited: historians battle for the Vietnam War (Xem lại chiến thắng: giới sử học chiến đấu cho chiến tranh Việt Nam, 2010),[9] một bộ sưu tập những nhận định chi tiết về cuốn sách của 15 nhà sử học hàn lâm khác nhau. Các đánh giá được đính kèm với phản hồi của Moyar, người thách thức những lời chỉ trích về tác phẩm của mình.